影片按照迪士尼乐土游玩项目“森林巡航”改编，故事产生在野心家与探险家并起的上世纪初，英勇无畏的女科学家莉莉·霍顿博士（艾米莉·布朗特 饰） 来到亚马逊寻觅有治愈魔力的神树，并雇佣了玩世不恭的弗兰克船主（道恩·强森 饰）开启探险。在这史诗般的冒险途中，看似不合错误盘的两人在茂盛雨林中遭受了无数的危险和超天然气力。但跟着这棵奇异古树的奥秘逐步揭开，莉莉和弗兰克的命运，甚至全部人类的命运都朝不保夕。他们虽然都是自己领域的专业人士，但是很多人也是第一次面对这样紧迫危机的状况。